122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0687 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  56.25 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  54.29 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  55.38 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  53.08 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  53.08 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  53.62 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  54.33 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  49.61 
 
 		 374 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  50.75 
 
 		 136 aa  136  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  51.43 
 
 		 209 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  53.79 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  50.77 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  48.82 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  48.82 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  52.59 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  48.82 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  51.97 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  46.15 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  42.07 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  49.54 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  49.09 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  47.11 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  48.8 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  44.95 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  40.94 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  45.37 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  40.88 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  41.8 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  43.59 
 
 		 147 aa  96.7  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  45.05 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  39.5 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  39.5 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  35.09 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  28.8 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  32.22 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  32.1 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  29.82 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  29.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  32.77 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  32.14 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  30.47 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  27.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  33.33 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  32.18 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  35.23 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  27.5 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  28.07 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  28.07 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  28.07 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  23.91 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  25.61 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  25.3 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>