118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0468 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  99.17 
 
 
120 aa  239  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  99.16 
 
 
123 aa  237  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  72.97 
 
 
124 aa  174  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  63.48 
 
 
122 aa  157  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  57.14 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  52.1 
 
 
123 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  51.69 
 
 
124 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  59.05 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  52.21 
 
 
122 aa  124  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  34.57 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  32.97 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  39.44 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  30.86 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  40.85 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  42.62 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  29.25 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  27.59 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  31.87 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  34.52 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  30.68 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  32.91 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  29.29 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  28.26 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  26.26 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  26.73 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  28.44 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  26.92 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  28.44 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  27.62 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  34.57 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  34.12 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  24.77 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  35.06 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  32.53 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  28.24 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  23.76 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  27.85 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  26.25 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  34.48 
 
 
155 aa  52  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  28.75 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  32.76 
 
 
144 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  31.18 
 
 
143 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  27.1 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  29.11 
 
 
141 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  26.14 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  24.42 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  28.07 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  24.71 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  26.25 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  32.94 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  27.06 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  25 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 
139 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  23.26 
 
 
151 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>