137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1289 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  64.54 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  62.68 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  69.35 
 
 		 163 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  69.35 
 
 		 158 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  59.15 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  67.57 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  62.32 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  56 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  53.23 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  48.57 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  47.48 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  47.48 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  47.48 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  46.04 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  46.04 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  50.81 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  46.04 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  46.72 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  48.97 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  50.81 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  50.81 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  50.81 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  42.18 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  37.17 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  33.82 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  47.95 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  30.5 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  32.37 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  41.77 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  36.73 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  32.74 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  31.65 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  42.68 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  35.58 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  38 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  37.5 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  41.43 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  37.5 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  39.77 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 374 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  32.77 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  37.93 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  32.73 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  38.54 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  42.25 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  34.58 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  28.18 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  43.94 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  38.64 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  34.18 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  36.23 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  38.46 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  41.79 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  35.06 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  35.06 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  36.14 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  37.8 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  30.43 
 
 		 1077 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  30.93 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  38.37 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>