128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1261 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  76.06 
 
 		 209 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  77.54 
 
 		 144 aa  228  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  77.3 
 
 		 141 aa  226  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  74.64 
 
 		 142 aa  213  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  65.96 
 
 		 143 aa  200  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  66.91 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  67.38 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  69.78 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  71.32 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  69.77 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  53.54 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  55.38 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  50.78 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  49.22 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  45.07 
 
 		 374 aa  136  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  45.14 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  48.84 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  43.61 
 
 		 142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  48.82 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  49.24 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  50.39 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  48.85 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  46.97 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  45.04 
 
 		 165 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  45.31 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  44.27 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  39.53 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  45.31 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  38.76 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  43.2 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  41.73 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  41.67 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  41.35 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  41.09 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  36.51 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  40 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  33.88 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  35.79 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  39.33 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  36.28 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  32.99 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  34.04 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  34.12 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  29.23 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  34.12 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  31.46 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  32.29 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  35.42 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  32.95 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  28.28 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  32.18 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  30.77 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.68 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>