117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2867 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  65.41 
 
 
144 aa  182  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  48.82 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  49.61 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  50.37 
 
 
136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  49.61 
 
 
134 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  50.37 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  48.44 
 
 
134 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 
142 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  49.58 
 
 
165 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  49.58 
 
 
134 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
139 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
161 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  46.96 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
139 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  47.9 
 
 
209 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  44.35 
 
 
165 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  47.11 
 
 
138 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  45.83 
 
 
141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  39.1 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 
144 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  46.56 
 
 
139 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  45.9 
 
 
143 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  45.9 
 
 
143 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  44.26 
 
 
142 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  45.22 
 
 
143 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  44.35 
 
 
143 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
140 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  37.31 
 
 
144 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
159 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
139 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
147 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  39.01 
 
 
374 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  39.69 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  44.76 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  38.84 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  40.18 
 
 
159 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  40.54 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  40 
 
 
142 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  37.19 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  32.06 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  39.5 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  35.79 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  36.26 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  38.3 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  32.63 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  30 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  32.29 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  27.55 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  27.45 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  29.55 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  30.93 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  28.18 
 
 
141 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 
142 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  27.66 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  31.65 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  31.65 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  31.65 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  25 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  30.3 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  26.32 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>