115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1138 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 
142 aa  298  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  59.59 
 
 
164 aa  176  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  58.57 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  43.62 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  43.3 
 
 
138 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  42.55 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  42.55 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  42.55 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3382  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.67 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  27.42 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  26.61 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  27.42 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  26.4 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  36.14 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  29.06 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  34.55 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  28.28 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  28.45 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2366  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 
153 aa  53.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  27.18 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  27.68 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  31.68 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  27.78 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  24.79 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  26.74 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  26.79 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  24.79 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  21.71 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  32.05 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  31.4 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  36.23 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  34.12 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  29.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  36.36 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  28 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  19.26 
 
 
143 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  26.73 
 
 
145 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  22.22 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  19.49 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  26.6 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  27.08 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  27.72 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  28.72 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  23.66 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  26.26 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  26.21 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  22.58 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  31.51 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  24.55 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  29.29 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  31.87 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  25.64 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  25.21 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  33.78 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  22.4 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  29.25 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  23.4 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  29.25 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  22.4 
 
 
134 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  23.23 
 
 
143 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  22.34 
 
 
138 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  25.49 
 
 
138 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>