118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3650 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  35.46 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  36.51 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  39.06 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  38.17 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  34.13 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  36.36 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  37.27 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  34.13 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  35.16 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  32.03 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  33.06 
 
 		 374 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  40.91 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  38.74 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  35.43 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  32.23 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  31.5 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  38.89 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  33.07 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  33.07 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  32.5 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  33.06 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  41.76 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  29.69 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  32.28 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  33.04 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  33.04 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  28.7 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  35.87 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  37.93 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  33.67 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  29.67 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  29.67 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  28.72 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  24.76 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  31.63 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  32.05 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  29.67 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  25 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  25.25 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  26.26 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  31.58 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  28.57 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  27.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  33.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  23.26 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  23.26 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  26.88 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  31.94 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  21.82 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  24.79 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  29.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  26.97 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  27.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  25 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  28.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  28.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  28.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  28.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  28.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>