267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0368 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  90.44 
 
 		 141 aa  256  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  69.57 
 
 		 147 aa  204  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  67.88 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  66.42 
 
 		 145 aa  200  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  54.48 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  54.48 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  55.28 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  50.34 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  52.52 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  56.41 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  51.47 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  47.73 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  52.54 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  44.78 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  50.38 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  51.09 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  46.83 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  44.06 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  32.85 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  33.58 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  38.75 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  41.67 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  30.5 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  39.33 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  35.8 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.69 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  37.08 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  30.25 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  34.34 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  34.34 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  34.34 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  28.81 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  33.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  28.93 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  33.67 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  24.51 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  25.25 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  26.92 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  34.83 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  33.71 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  30.84 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  30.1 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  33.04 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  28.33 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  27.64 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  28.93 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  28 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  30.19 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  24.11 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  31.53 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  23.94 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>