163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2873 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 141 aa  295  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  53.73 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3902  hypothetical protein  45.65 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.286903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  30.25 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  29.75 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  29.92 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  29.75 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  30.58 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  28.26 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  26.15 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  35.62 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  30.58 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  27.73 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  27.01 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  26.83 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  26.36 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  27.01 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  27.01 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  26.36 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  28.1 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  30.89 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  25.35 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  25.35 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  26.02 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  32.05 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  26.56 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  24.03 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  26.27 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  32.23 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  34.26 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0713  HIT family protein  33.64 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0556  HIT (histidine triad) family protein  31.93 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000140034  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  29.57 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  25.42 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  22.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  24.79 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  23.97 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0681  HIT  31.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0189607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  26.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  23.08 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  22.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  25.58 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  30.48 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  21.88 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  28.26 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.93 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  25.78 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  25.27 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  25.24 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  31.43 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  25.66 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0645  HIT family protein  31.43 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  25.83 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  25.83 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0702  hydrolase, HIT family  31.87 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  22.83 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  29.71 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  29.71 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  24.79 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  23.93 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  30.49 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  30.97 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  23.76 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  27.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  24.42 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>