112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3902 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.286903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  45.65 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  45.74 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  39.5 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  31.39 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  30.65 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  30.22 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  28.93 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  27.94 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  28.99 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  26.85 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  28.21 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  28.21 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  27.27 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  29.2 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  27.27 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  27.03 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  33.64 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  28.83 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  29.63 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  28.97 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  25.23 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  26.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  26.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  26.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  26.79 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  26.96 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  26.79 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  25.89 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  28.04 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  28.93 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  27.62 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  23.23 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  24.04 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 374 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  37.68 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  26.42 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  23.96 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  26.39 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3241  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022534  hitchhiker  0.0000789842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  25.44 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  24.14 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  23.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  32.94 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  27.36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  27.36 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  23.81 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  24.76 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  28.3 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  26.42 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  25.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  24.49 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  27.12 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  27.37 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  26.67 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  26.42 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  25.22 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  22.48 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  25.71 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  27.37 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2069  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0334807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  31.76 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  25.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  26.76 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  26.24 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  28 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  21.15 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  27.91 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  27.72 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  26.23 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>