41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3241 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3241  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022534  hitchhiker  0.0000789842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  27.62 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  26.61 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2069  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0334807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  26.67 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  26.67 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  25.23 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  31.48 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1945  hypothetical protein  29.2 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  43.94 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  43.94 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  43.94 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2542  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.572696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  43.94 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  30.56 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  31.07 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  29.52 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  29.52 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  26.44 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  28.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  28.57 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1273  hypothetical protein  31.34 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2813  hypothetical protein  36.96 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00386809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  27.78 
 
 
146 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1211  hypothetical protein  24.79 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1616  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>