50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2069 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2069  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0334807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  35.92 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  36.69 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  37.41 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  36.69 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  35 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00386809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  32.87 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1273  hypothetical protein  34.48 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1211  hypothetical protein  29.09 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3241  hypothetical protein  36.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022534  hitchhiker  0.0000789842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  29.73 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  34.82 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  31.75 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  31.75 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13611  hypothetical protein  31.07 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3441  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000440827  hitchhiker  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  28.04 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  30.17 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  35.11 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  35.11 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  31.13 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  28.97 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  35.05 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  27.63 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  34.51 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  27.5 
 
 		 118 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  26.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  24.3 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  30.36 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  34.57 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4435  HIT family hydrolase  45 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  27.52 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  27.1 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  27.83 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 120 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>