55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5939 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  35.17 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6406  hypothetical protein  52.05 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  37.6 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  45.12 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  45.12 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  40.26 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  38.96 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1273  hypothetical protein  33.94 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  37.66 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  38.96 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  37.66 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  37.66 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2271  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3241  hypothetical protein  34.55 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022534  hitchhiker  0.0000789842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3551  hypothetical protein  30.34 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.827618  normal  0.306763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  34.71 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1579  histidine triad (HIT) protein  30.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.28646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42050  hypothetical protein  27.78 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2597  hypothetical protein  24.44 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5046  histidine triad (HIT) protein  28.16 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  36.62 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  25.81 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39870  putative hydrolase  26.97 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  36.62 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  40.58 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  36.62 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1945  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0687  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  37.18 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1211  hypothetical protein  28.41 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  30.09 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  24.49 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  41.43 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5103  hypothetical protein  32.22 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13611  hypothetical protein  37.31 
 
 		 151 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4585  hypothetical protein  29.25 
 
 		 336 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418826  hitchhiker  0.000563386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  32.39 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.48 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.8 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  27.47 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06189  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11700)  37.5 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 		 138 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>