136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0781 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  89.37 
 
 		 348 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 348 aa  731    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  92.53 
 
 		 348 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  92.53 
 
 		 348 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  92.53 
 
 		 348 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  92.53 
 
 		 348 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  92.53 
 
 		 348 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  99.14 
 
 		 348 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  83.91 
 
 		 350 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  83.19 
 
 		 362 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  81.61 
 
 		 350 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  81.9 
 
 		 350 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  81.61 
 
 		 350 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  79.89 
 
 		 350 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 		 346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.7 
 
 		 350 aa  544  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.04 
 
 		 372 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.05 
 
 		 346 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  72.54 
 
 		 350 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.04 
 
 		 350 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.72 
 
 		 349 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  63.85 
 
 		 354 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  63.85 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  70.97 
 
 		 350 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.46 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.93 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.8 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.68 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.99 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.64 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.31 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.11 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.49 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.27 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.91 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.73 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.68 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  50.42 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.35 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.28 
 
 		 381 aa  342  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.72 
 
 		 405 aa  341  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.49 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06182  galactose-1-phosphate uridylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G11560)  45.09 
 
 		 385 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.711563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.34 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  44.62 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.41 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.03 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.73 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.12 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.42 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.84 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.75 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.18 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  33.9 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.61 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.64 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.72 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  31.12 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.63 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.19 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.68 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.14 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  32.34 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.13 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.64 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.05 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.75 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.84 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.25 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.12 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.53 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
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NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.12 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  28.48 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.25 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.75 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
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NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.77 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.52 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.12 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU3256  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.54 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.19 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.54 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0608445 
 
 
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NC_010814  Glov_0409  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.87 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.28 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
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NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.35 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.565046 
 
 
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NC_007517  Gmet_3176  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  27.46 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.326175 
 
 
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NC_008609  Ppro_0026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.76 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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