146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1561 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
318 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
318 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.64 
 
 
320 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.94 
 
 
318 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.25 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.3 
 
 
329 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.48 
 
 
329 aa  288  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.72 
 
 
329 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.06 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.94 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.25 
 
 
329 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.17 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  39.38 
 
 
374 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.97 
 
 
327 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.89 
 
 
360 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  39.31 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.01 
 
 
382 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.3 
 
 
347 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.94 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35 
 
 
392 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.39 
 
 
385 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.28 
 
 
345 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.94 
 
 
346 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.81 
 
 
361 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.88 
 
 
359 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.89 
 
 
360 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.45 
 
 
364 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.84 
 
 
347 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.89 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.68 
 
 
314 aa  199  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.35 
 
 
313 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.92 
 
 
361 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  35.02 
 
 
342 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.22 
 
 
365 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.45 
 
 
366 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.12 
 
 
356 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.4 
 
 
336 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.4 
 
 
336 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.22 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.55 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.79 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.53 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.45 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.24 
 
 
353 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.4 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
349 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.54 
 
 
381 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.24 
 
 
344 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.53 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.94 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  32.63 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.03 
 
 
405 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.13 
 
 
348 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.13 
 
 
348 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.13 
 
 
348 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.13 
 
 
348 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.13 
 
 
348 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.21 
 
 
359 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.42 
 
 
348 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.42 
 
 
348 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.42 
 
 
348 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.42 
 
 
348 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.79 
 
 
362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.08 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.42 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.87 
 
 
423 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.14 
 
 
350 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.42 
 
 
346 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.75 
 
 
386 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.67 
 
 
350 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.67 
 
 
350 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.67 
 
 
350 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.01 
 
 
351 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.55 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.33 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1083  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.45 
 
 
329 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135075  hitchhiker  0.0000927283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.72 
 
 
348 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1933  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.38 
 
 
343 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.120922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1106  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.12 
 
 
336 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.15 
 
 
338 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1323  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.09 
 
 
351 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.12 
 
 
354 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.12 
 
 
347 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  32.14 
 
 
379 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0450  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.14 
 
 
341 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.59 
 
 
358 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0076  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 
332 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.38 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.21 
 
 
363 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0409  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.94 
 
 
341 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.13 
 
 
323 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.44 
 
 
357 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.88 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>