136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2084 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 357 aa  752    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  72.7 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  72.41 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  69.14 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.05 
 
 		 364 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.25 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.25 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.29 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.29 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.29 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.29 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.29 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.4 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.06 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.06 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.06 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.06 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.06 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
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NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  60.4 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.398419 
 
 
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NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.96 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  64.42 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.13 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.48 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.64 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.48 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.33 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.2 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.62 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.45 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.503594 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.88 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.29 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.71 
 
 		 350 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.71 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.15 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.34 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.53 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.54 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
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NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.49 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.07 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.56 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.88 
 
 		 348 aa  348  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.330674 
 
 
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NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  49.32 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.530711 
 
 
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NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.34 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.12 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  45.99 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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BN001301  ANIA_06182  galactose-1-phosphate uridylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G11560)  44 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.711563 
 
 
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NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.21 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.96 
 
 		 381 aa  295  9e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.19 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.48 
 
 		 454 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.57 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.04 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.97 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.83 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.15 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.74 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.73 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.64 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.34 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.55 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.74 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.44 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.44 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.12 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.59 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.75 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.02 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.74 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.61 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.56 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  28.48 
 
 		 359 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  28.01 
 
 		 374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.76 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  29.91 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.4 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  29.91 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.16 
 
 		 416 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.52 
 
 		 382 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.21 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.26 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.74 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.28 
 
 		 423 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.01 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.38 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.76 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.53 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.78 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.7 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
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NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.3 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.63 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.39 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.22 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0450  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.88 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1933  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.78 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120922 
 
 
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NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
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NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.01 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.28 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.565046 
 
 
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