136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4017 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  93.35 
 
 		 361 aa  694    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 361 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  66.67 
 
 		 360 aa  484  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  70 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.22 
 
 		 359 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.37 
 
 		 346 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.45 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.97 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  46.39 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.41 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  41.57 
 
 		 374 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  40.74 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.7 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.25 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.72 
 
 		 360 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1933  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.57 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.5 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.81 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.31 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  38.68 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.44 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.53 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.68 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.15 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  37.57 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.93 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.06 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.36 
 
 		 347 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.63 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.81 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.81 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.89 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35 
 
 		 324 aa  206  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.15 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.4 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.98 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.31 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 416 aa  185  9e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.65 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.63 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.4 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.42 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.04 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.04 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.68 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.06 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.02 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.22 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.03 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.81 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.5 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.63 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.9 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.45 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.36 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.85 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.74 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.73 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.02 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.02 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.02 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.24 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.82 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.38 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.35 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.27 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.83 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.23 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.07 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.61 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.565046 
 
 
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NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  29.36 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.58 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.58 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.12 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.43 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
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NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.53 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.33 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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