136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2953 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 346 aa  722    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  93.35 
 
 		 346 aa  685    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.34 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.34 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.34 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.34 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.05 
 
 		 348 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.05 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.05 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.22 
 
 		 348 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.68 
 
 		 362 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.39 
 
 		 350 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  72.51 
 
 		 350 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  71.72 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  71.72 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  68.22 
 
 		 349 aa  524  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  71.72 
 
 		 350 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  66.86 
 
 		 372 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.63 
 
 		 350 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.44 
 
 		 350 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.34 
 
 		 350 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.503594 
 
 
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NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  69.21 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  63.74 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
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NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.1 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
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NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  63.74 
 
 		 354 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.68 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.01 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.96 
 
 		 357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.99 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.38 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.95 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.41 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.82 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.85 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.73 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.46 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.84 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.14 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  48.88 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.530711 
 
 
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NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.06 
 
 		 348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.44 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.83 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  48.12 
 
 		 384 aa  328  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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BN001301  ANIA_06182  galactose-1-phosphate uridylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G11560)  44.24 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.711563 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.42 
 
 		 381 aa  322  4e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.94 
 
 		 454 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.35 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.82 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.63 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.42 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.42 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.82 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.5 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.91 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.55 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.4 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.76 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  34.93 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.04 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.73 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  31.82 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.73 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.3 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.29 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.94 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.44 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.51 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  32.12 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.9 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.82 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.94 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.44 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.79 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.62 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.68 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.25 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.8 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  29.34 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.02 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
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NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.79 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
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NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 		 385 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.05 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0608445 
 
 
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NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.64 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
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NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.52 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.83 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.83 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.81 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.13 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.13 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.565046 
 
 
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NC_013124  Afer_0499  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.3 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.203347  n/a   
 
 
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