136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1325 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  93.35 
 
 
346 aa  663    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
346 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 
348 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.97 
 
 
348 aa  564  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 
348 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 
348 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 
348 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.51 
 
 
348 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.22 
 
 
348 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.32 
 
 
348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.32 
 
 
348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.32 
 
 
348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.32 
 
 
348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.32 
 
 
348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.22 
 
 
348 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  75.15 
 
 
350 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  74.56 
 
 
362 aa  547  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.39 
 
 
350 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.68 
 
 
350 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.68 
 
 
350 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  73.68 
 
 
350 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.93 
 
 
349 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.44 
 
 
350 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.92 
 
 
350 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  66.57 
 
 
372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  67.34 
 
 
350 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  70.38 
 
 
350 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  64.62 
 
 
347 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  64.33 
 
 
354 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.68 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.68 
 
 
364 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.25 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.99 
 
 
363 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.43 
 
 
350 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  59.08 
 
 
329 aa  421  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.65 
 
 
341 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.24 
 
 
359 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.89 
 
 
356 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.68 
 
 
345 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.41 
 
 
355 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.68 
 
 
351 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.76 
 
 
348 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.57 
 
 
353 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.74 
 
 
358 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  49.44 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.42 
 
 
395 aa  348  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.35 
 
 
348 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.06 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.6 
 
 
381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  48.38 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06182  galactose-1-phosphate uridylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G11560)  45.31 
 
 
385 aa  326  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.711563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.9 
 
 
454 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.46 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.33 
 
 
320 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.22 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.22 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.63 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.73 
 
 
361 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.52 
 
 
329 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.4 
 
 
329 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.83 
 
 
392 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.04 
 
 
364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  35.29 
 
 
404 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.56 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.94 
 
 
324 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.82 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.72 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.29 
 
 
423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  31.21 
 
 
374 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.88 
 
 
386 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.83 
 
 
324 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
360 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.22 
 
 
338 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.53 
 
 
360 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.2 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  32.12 
 
 
342 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.04 
 
 
381 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.21 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.74 
 
 
366 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 
347 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.69 
 
 
361 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.48 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.24 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.91 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.82 
 
 
327 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.23 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.23 
 
 
416 aa  136  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.18 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  29.09 
 
 
359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
346 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.95 
 
 
346 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.88 
 
 
333 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.6 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.61 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0499  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.203347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.25 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.25 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
313 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.84 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>