138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  100 
 
 
342 aa  690    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  62.67 
 
 
364 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  61.92 
 
 
347 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  58.33 
 
 
359 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  56.58 
 
 
359 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.46 
 
 
366 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  56.32 
 
 
360 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  54.27 
 
 
374 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.34 
 
 
392 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.29 
 
 
345 aa  351  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.26 
 
 
382 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.02 
 
 
381 aa  340  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.5 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  49.37 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.7 
 
 
365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.95 
 
 
423 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.17 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.52 
 
 
405 aa  311  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.9 
 
 
416 aa  272  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.66 
 
 
361 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.31 
 
 
329 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.19 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.23 
 
 
360 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.68 
 
 
361 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.62 
 
 
359 aa  225  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.79 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.38 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.28 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.5 
 
 
346 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.59 
 
 
320 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.02 
 
 
318 aa  195  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.02 
 
 
318 aa  195  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.53 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.19 
 
 
338 aa  186  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.91 
 
 
324 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.35 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1933  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.61 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.120922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.18 
 
 
329 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.22 
 
 
327 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.8 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.83 
 
 
372 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.93 
 
 
350 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.43 
 
 
350 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.21 
 
 
313 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.23 
 
 
348 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.13 
 
 
350 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.84 
 
 
347 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10630  galactose-1-phosphate uridylyltransferase galTb  50.63 
 
 
156 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000345015  normal  0.922066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.12 
 
 
346 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.82 
 
 
348 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.02 
 
 
350 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.33 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.33 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.33 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.33 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
348 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
348 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
348 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
348 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
348 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.34 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.02 
 
 
348 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10629  galactose-1-phosphate uridylyltransferase galTa  49.17 
 
 
231 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000850534  normal  0.554989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.73 
 
 
362 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.53 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.21 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.12 
 
 
346 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.91 
 
 
350 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.48 
 
 
327 aa  142  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.03 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.94 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.52 
 
 
348 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.13 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.91 
 
 
357 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.19 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31 
 
 
347 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.82 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.48 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.51 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.12 
 
 
350 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.12 
 
 
350 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.48 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.08 
 
 
364 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.97 
 
 
350 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.73 
 
 
381 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  29.21 
 
 
384 aa  123  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.88 
 
 
359 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.77 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.16 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.68 
 
 
454 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.14 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.51 
 
 
356 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.45 
 
 
336 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.45 
 
 
336 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.04 
 
 
333 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.71 
 
 
340 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.87 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.3 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  25.43 
 
 
379 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.530711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>