144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3652 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
358 aa  753    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.68 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.02 
 
 
359 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  57.35 
 
 
355 aa  401  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  56.14 
 
 
351 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.46 
 
 
353 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1467  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.78 
 
 
356 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.78 
 
 
350 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0861  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.73 
 
 
348 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.14597  normal  0.922241 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.73 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.2 
 
 
362 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1292  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.03 
 
 
350 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.78 
 
 
345 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0679  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
348 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1325  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.74 
 
 
346 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.46 
 
 
348 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.16 
 
 
349 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.56 
 
 
350 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  53.53 
 
 
348 aa  359  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2953  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.45 
 
 
346 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.18 
 
 
347 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.18 
 
 
354 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2856  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.62 
 
 
350 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2944  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.62 
 
 
350 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.44 
 
 
350 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1412  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  52.33 
 
 
350 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1631  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50 
 
 
364 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06182  galactose-1-phosphate uridylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G11560)  47.27 
 
 
385 aa  345  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.711563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2016  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.71 
 
 
350 aa  345  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.503594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2288  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50 
 
 
363 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03650  UTP-hexose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  50.41 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3248  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.92 
 
 
350 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.69 
 
 
372 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.69 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.04 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002661  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.11 
 
 
350 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.974844  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57493  galactose-1-phosphate uridyl transferase  48.15 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00620  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.28 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  47.87 
 
 
329 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2084  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.12 
 
 
357 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4683  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.06 
 
 
395 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3452  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  42.42 
 
 
405 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116416  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.86 
 
 
454 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.5 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 
329 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.74 
 
 
329 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.93 
 
 
329 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.83 
 
 
324 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.65 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.31 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.14 
 
 
329 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.44 
 
 
318 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.85 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.88 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.43 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.14 
 
 
382 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.59 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.59 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.52 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.74 
 
 
347 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  31.69 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.06 
 
 
360 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.92 
 
 
365 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  30.9 
 
 
359 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.43 
 
 
314 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.56 
 
 
359 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.01 
 
 
423 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.9 
 
 
361 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.35 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.41 
 
 
366 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.15 
 
 
385 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  29.94 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.32 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.68 
 
 
386 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.88 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.16 
 
 
346 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.27 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  29.57 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.82 
 
 
333 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.92 
 
 
405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.73 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.8 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.02 
 
 
360 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.08 
 
 
346 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.12 
 
 
344 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0141  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.56 
 
 
333 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0152  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.95 
 
 
333 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0499  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.95 
 
 
332 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.203347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1106  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.83 
 
 
336 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2741  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.03 
 
 
333 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00698708  unclonable  0.00000000287618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3370  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.03 
 
 
333 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>