11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39870  putative hydrolase  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2271  hypothetical protein  54.43 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3551  hypothetical protein  55.41 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.827618  normal  0.306763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2597  hypothetical protein  54.43 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42050  hypothetical protein  54.37 
 
 		 160 aa  184  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  26.97 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  32.39 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0423  hypothetical protein  28.41 
 
 		 152 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  33.8 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3064  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.284602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1308  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase-like protein  29.21 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>