13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1308 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1308  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase-like protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2239  histidine triad (HIT) protein  75.18 
 
 		 142 aa  214  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3064  histidine triad (HIT) protein  51.08 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.284602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0423  hypothetical protein  52.42 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1680  hypothetical protein  51.45 
 
 		 145 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237094  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2771  histidine triad (HIT) protein  53.91 
 
 		 143 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5427  hypothetical protein  52.13 
 
 		 168 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1897  hypothetical protein  67.44 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324191  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2379  hypothetical protein  67.65 
 
 		 84 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1039  hypothetical protein  67.65 
 
 		 84 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3330  hypothetical protein  64.71 
 
 		 80 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  36.76 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39870  putative hydrolase  29.21 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>