41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2239 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2239  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1308  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase-like protein  75.18 
 
 		 210 aa  214  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3064  histidine triad (HIT) protein  55.47 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.284602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0423  hypothetical protein  51.59 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1680  hypothetical protein  53.68 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237094  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2771  histidine triad (HIT) protein  53.44 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5427  hypothetical protein  49.46 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  35.8 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  38.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3551  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.827618  normal  0.306763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  27.03 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  35.29 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 163 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 158 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  30.23 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  26.36 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2271  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  34.55 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  26.19 
 
 		 146 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>