26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3064 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3064  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.284602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1680  hypothetical protein  55.32 
 
 
145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237094  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2239  histidine triad (HIT) protein  55.47 
 
 
142 aa  154  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0423  hypothetical protein  49.62 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1308  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase-like protein  51.08 
 
 
210 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40379  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2771  histidine triad (HIT) protein  54.47 
 
 
143 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5427  hypothetical protein  54.26 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  31.82 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2271  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  30.71 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  32.97 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 
138 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39870  putative hydrolase  32.58 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  27.38 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  32.32 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  26.32 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>