122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2919 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  49.56 
 
 
147 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  38.81 
 
 
155 aa  95.9  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  40.6 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  41.09 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 
139 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  42.98 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  39.06 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  41.09 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 
139 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
374 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 
165 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  39.84 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  39.52 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  39.68 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  37.31 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  38.74 
 
 
141 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  34.68 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  34.68 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  41.73 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  38.1 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  43.12 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  35.82 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  37.59 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  39.83 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  39.57 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  34.71 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  37.04 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  36.23 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  36.03 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  36 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  43.94 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  27.62 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  27.62 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  26.85 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  28 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  28.05 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  33.68 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  31.82 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  43.33 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  30.17 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  26.44 
 
 
122 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  31.87 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  29.7 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  29.7 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  29.29 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  28.28 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  36.71 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  24.1 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  50 
 
 
123 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>