19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1211 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1211  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  321  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1273  hypothetical protein  67.48 
 
 
155 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13611  hypothetical protein  56.03 
 
 
151 aa  176  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  28.95 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  28.95 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  27.35 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2069  histidine triad (HIT) protein  29.09 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0334807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  27.35 
 
 
183 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  27.19 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  26.5 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  27.19 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  27.36 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  26.67 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  25.71 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  25.71 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0687  hypothetical protein  30.95 
 
 
272 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  28.41 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2813  hypothetical protein  28 
 
 
159 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00386809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3241  hypothetical protein  24.79 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022534  hitchhiker  0.0000789842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>