21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0687 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0687  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  28.95 
 
 
159 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  28.81 
 
 
183 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  28.95 
 
 
159 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  28.81 
 
 
159 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  27.64 
 
 
159 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  28.95 
 
 
172 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13611  hypothetical protein  32.76 
 
 
151 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1783  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52614  normal  0.714247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0266  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000064086  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1273  hypothetical protein  36.25 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2026  hypothetical protein  33.78 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1852  hypothetical protein  33.78 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1937  hypothetical protein  33.78 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1945  hypothetical protein  31.29 
 
 
199 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6478  hypothetical protein  32.94 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.148585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4585  hypothetical protein  34.13 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418826  hitchhiker  0.000563386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1211  hypothetical protein  30.95 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
151 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4338  hypothetical protein  30.33 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00171675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5103  hypothetical protein  38.1 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>