83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1508 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  35.79 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  36.78 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  32.18 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  32.29 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  34.48 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  30.23 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  30.59 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 374 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  30.12 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  28.43 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  28.87 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  32.05 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  28.87 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  32.18 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  28.85 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  31.76 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  30.68 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  26.67 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  26.17 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  28.74 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  30.59 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  28.74 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  27.97 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  29.07 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  25.24 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  29.89 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  25.24 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  30.3 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  27.59 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  29.31 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  27.37 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  31.4 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  35.48 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  28.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  29.89 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  29.46 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  32.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  28.72 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  28.3 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  28.3 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  28.12 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  30 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  29.55 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 141 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>