More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0883 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0883  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
134 aa  277  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.877405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  40 
 
 
139 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  40.15 
 
 
144 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  40.15 
 
 
144 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.42 
 
 
165 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
139 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 
151 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
144 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 
139 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 
143 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  37.98 
 
 
130 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
140 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 
148 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  37.98 
 
 
130 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.77 
 
 
132 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
130 aa  100  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
139 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  44.95 
 
 
139 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 
139 aa  95.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  36.3 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
140 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  31.85 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  34.85 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  36.64 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
142 aa  87  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 
135 aa  87  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  33.82 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  34.13 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  34.56 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  32.82 
 
 
455 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  34.35 
 
 
140 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  34.35 
 
 
140 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  32.85 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  34.31 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  26.87 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.6 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.06 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  32.82 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.59 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  33.96 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  32.31 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  27.61 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  33.96 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  29.32 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  34.13 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  32.77 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  29.32 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>