More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1616 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1616  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  37.9 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  43.51 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.55 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  38.71 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.6 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  35.4 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  35.4 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  22.46 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  35.19 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  33.33 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0713  HIT family protein  30.34 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  29.29 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.03 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0702  hydrolase, HIT family  28.28 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  30.89 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  27.93 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  29.63 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  29.29 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0556  HIT (histidine triad) family protein  27.27 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000140034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  33.61 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  30.61 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  26.4 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  32.35 
 
 		 1077 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  33.33 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.29 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  21.09 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0645  HIT family protein  21.09 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  29.27 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  32.17 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  30.26 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  35.9 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  33.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  31.97 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 		 455 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  31.48 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  33.62 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0681  HIT  27.27 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0189607  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  29.85 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  34.48 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  29.91 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  33.05 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  34.21 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  32.76 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.74 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>