More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0143 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  100 
 
 
161 aa  340  4e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1953  Hit family protein  83.75 
 
 
161 aa  270  7e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  68.12 
 
 
165 aa  236  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  62.65 
 
 
168 aa  218  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  64.97 
 
 
161 aa  216  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  64.33 
 
 
161 aa  215  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  64.33 
 
 
161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  59.88 
 
 
162 aa  204  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1305  histidine triad (HIT) protein  58.44 
 
 
163 aa  201  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  47.53 
 
 
166 aa  167  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
164 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
172 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  45.62 
 
 
169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  42.01 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  45.16 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
162 aa  147  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 
162 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 
172 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  43.23 
 
 
298 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  44.72 
 
 
162 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  42.77 
 
 
184 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  42.68 
 
 
169 aa  141  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  44.1 
 
 
169 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  39.87 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  42.41 
 
 
165 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  40.25 
 
 
166 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
173 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  38.36 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  40.25 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  42.07 
 
 
165 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  42.77 
 
 
166 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  39.61 
 
 
160 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  36.48 
 
 
160 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  43.51 
 
 
164 aa  136  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  40.48 
 
 
178 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
165 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 
165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  43.29 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
173 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
168 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  42.14 
 
 
174 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  42.07 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  37.8 
 
 
179 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  39.38 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  35.76 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  39.62 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  41.36 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  42.07 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  40.12 
 
 
160 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  41.72 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  40.51 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  38.36 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  36.81 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
192 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
229 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  39.38 
 
 
163 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.65 
 
 
194 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  33.54 
 
 
180 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 
206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
190 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  35.86 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  38.62 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  34.57 
 
 
183 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  34.39 
 
 
161 aa  111  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  35.1 
 
 
195 aa  110  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  39.68 
 
 
190 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  35.37 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 
220 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.62 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  35.37 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 
244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 
244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1987  histidine triad (HIT) protein  40.5 
 
 
169 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.43 
 
 
187 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
152 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.220033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  31.1 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  35.21 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
250 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  40.94 
 
 
185 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0894  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
152 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0649795  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  37.16 
 
 
181 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  41.94 
 
 
187 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1617  histidine triad (HIT) protein  37.19 
 
 
153 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  35.86 
 
 
181 aa  101  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  32.47 
 
 
193 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 
192 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  37.59 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.16 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  35.46 
 
 
182 aa  97.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 
191 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  35.81 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  34.69 
 
 
184 aa  94  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>