242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2769 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 169 aa  346  7e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  45.95 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  58.67 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  40.59 
 
 		 263 aa  81.3  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  53.62 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  43.62 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  52.17 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  51.95 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  52.11 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  47.12 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  48.75 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  38.79 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  47.67 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  50.7 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  42.55 
 
 		 263 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  36.8 
 
 		 275 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  63.46 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  40.23 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  40.78 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  43.68 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  45.07 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  60.38 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  39.18 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  42.55 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  44.74 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  39.34 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  39.18 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  44.05 
 
 		 242 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  36.84 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  41.24 
 
 		 253 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  39.81 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  44.9 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  45.33 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  41.76 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  46.48 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  46.48 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  38.75 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  36.94 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.89 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  43.24 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  44.12 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  38 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  36.54 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  41.86 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  40.96 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  41.86 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  41.86 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  38.83 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  39.08 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  39.18 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  42.42 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  39.76 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  43.75 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  40.96 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 221 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 221 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 		 256 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  41.77 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  33.03 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  54 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  45.07 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  54.17 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  40.22 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  42.03 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  32.11 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  29.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  34.38 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  45 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  36.67 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  44.12 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  39.06 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  47.27 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  52.94 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  38.75 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  37.84 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  38.05 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2909  flagellar hook capping protein  47.27 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  39.47 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  46.38 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  37.84 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  50.91 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>