249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2044 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  48.58 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  55.56 
 
 		 131 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  46.96 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  52.75 
 
 		 147 aa  89.7  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  42.61 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  34.06 
 
 		 180 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  45.36 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  36.11 
 
 		 145 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  40.5 
 
 		 142 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  43.12 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  39.84 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  63.16 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  48.1 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  46.08 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  42.73 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  39.66 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  51.95 
 
 		 169 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  42.06 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  41.03 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  41 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  33.9 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  41.27 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  45.68 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  45.57 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  47.76 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  49.25 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  39.56 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  51.32 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  43.33 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  39.56 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  30.71 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  57.63 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  62.75 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  39.17 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  41.9 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  45.78 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  49.33 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  35.4 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  57.78 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  57.78 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  42.7 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  41.94 
 
 		 152 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  48.28 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  56.25 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  36.75 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  57.78 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  36.75 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  35.96 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  35.77 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  43.21 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  35.14 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38.2 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  38.24 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  36.54 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  36.08 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  38.3 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  39.77 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  32.95 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  35.78 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  46.58 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  42.03 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  38.3 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  38.3 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  33.63 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.45 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  27.68 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  33.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  31.15 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  41.76 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.23 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  29.46 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  46.48 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  29 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  35.48 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  29.69 
 
 		 192 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  37.38 
 
 		 139 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2909  flagellar hook capping protein  57.14 
 
 		 100 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  34.91 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  44.93 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  34.48 
 
 		 142 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  29.46 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>