244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1657 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 175 aa  343  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  45.6 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  43.8 
 
 		 138 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  42.96 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  43.8 
 
 		 140 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  46.43 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  38.79 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  39.5 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  31.69 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  40.16 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 135 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  38.66 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  35.92 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  42.2 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  36.09 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  38.26 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 		 284 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  47.83 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  37.78 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  45.74 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  34.69 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  39.22 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  41.38 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  42.17 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  44.93 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  40.21 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.04 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  38.39 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  54 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  41.49 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  36.8 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  40.86 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  46.38 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  42.71 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  38.14 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  41.38 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  46.67 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  36.75 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  46.38 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  40.2 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  45.45 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  34.41 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  40.54 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.21 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  46.27 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  43.33 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  43.33 
 
 		 294 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  35.45 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  41.18 
 
 		 263 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  32.41 
 
 		 275 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  35.65 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  43.33 
 
 		 294 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  38.27 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  39.24 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  40.86 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  41.67 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  36.27 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  39.64 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  38.27 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  37.63 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  54.76 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  37.78 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  43.06 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  43.24 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  37.31 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  39.47 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  39.19 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>