209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0971 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 140 aa  276  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  45.67 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  43.8 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  44.29 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  38.64 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  39.37 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  33.58 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 		 323 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  41.18 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  35.19 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  41.75 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  36.29 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  29.77 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  40.74 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  35.59 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  35.56 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  40.4 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  29.75 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  39.56 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  39.56 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40.82 
 
 		 237 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  35.19 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  35.64 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  31.39 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  27.74 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  37.65 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  41.54 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  40.45 
 
 		 227 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.54 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  41.11 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  35.04 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  39.74 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  35.64 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  37.78 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  35.48 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  36.63 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  34.91 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  39.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  39.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  30.97 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  34.26 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  37.21 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  34.26 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.14 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  37.35 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  43.66 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  40.22 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  42.25 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  32.95 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  37.89 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  32.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  33.65 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.98 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  40.98 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  37.66 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  39.71 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  31.54 
 
 		 228 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  36.76 
 
 		 237 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  36.76 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  36.78 
 
 		 284 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 192 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  30.23 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  36.84 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  27.34 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.61 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  32.32 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  52.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  39.13 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  37.68 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>