248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0472 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 323 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  48.58 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  43.1 
 
 		 164 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  54.87 
 
 		 131 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  46.85 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  48.04 
 
 		 184 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  47.54 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  38.02 
 
 		 134 aa  86.7  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  41.32 
 
 		 142 aa  86.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  45.95 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  51.65 
 
 		 140 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  37.69 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  39.2 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  43.62 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  38.66 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  68.75 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  73.91 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  41.6 
 
 		 140 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.59 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  35.11 
 
 		 133 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  37.07 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  63.83 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  33.55 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  40.57 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  38.04 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  35.34 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  39.05 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  40.45 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  45.59 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  49.18 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  41.76 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  38.66 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  54.39 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.04 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  54.72 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  54.72 
 
 		 227 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  61.36 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  61.36 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  35.54 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  35.54 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  35.54 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  35.54 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  61.36 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  35.54 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  49.23 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  53.7 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  39.42 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  66.67 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  37.19 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  36.28 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  33.86 
 
 		 192 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  30.97 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  50.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  35.85 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  30.71 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  33.86 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  47.62 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  30.71 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1365  flagellar basal body rod modification protein  35.07 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  35.78 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  35.96 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  34.71 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  45.45 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 		 140 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  45.45 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 		 159 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  33.56 
 
 		 147 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  40.85 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  45.16 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  43.04 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  42.03 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  49.02 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  44 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  32.26 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  31.88 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  39.39 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  39.39 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  34.07 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  55.1 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  31.86 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  45.28 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  35.62 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>