252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0375 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  92.25 
 
 		 147 aa  230  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  54.13 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  46.09 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  54.63 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  46.85 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  48.44 
 
 		 190 aa  123  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  54.21 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  51.85 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  51.85 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  45.95 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  45.95 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  52.73 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  51.43 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  46.09 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  48.62 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  46.85 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  37.72 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  43.3 
 
 		 245 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  35.57 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  35.05 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  34.78 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  42.72 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  42.5 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  44.74 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  38.05 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  34.34 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  50.75 
 
 		 253 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  46.34 
 
 		 275 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  45.31 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  42.39 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  39.74 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  42.47 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  46.05 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  45 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  36.45 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  39.73 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  37.08 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  42.19 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  42.19 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  38.32 
 
 		 235 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  39.08 
 
 		 219 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  41.33 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  41.57 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  40.96 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  35.16 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  47.3 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  27.27 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.28 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  43 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  31 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  47.69 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  44.05 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  44.05 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  44.05 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  34.44 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  50 
 
 		 229 aa  57  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 		 247 aa  57  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  39.42 
 
 		 278 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28.47 
 
 		 238 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  44.62 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  44.16 
 
 		 248 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  48.44 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  41.46 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  44.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  34.91 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  31.93 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  41.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  41.89 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  35.05 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.24 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  41.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  41.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  41.89 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>