232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1336 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  98.2 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  67.45 
 
 		 218 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.4 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  42.59 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  41 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  41.55 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  34.3 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  33.5 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  35.35 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  31.66 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  31.66 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  31.8 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  28.99 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  34.46 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.71 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  31.1 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  29.57 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  33.88 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30.24 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  27.51 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  32.16 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  38.51 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30.67 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  48.53 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  29.22 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  48.53 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  48.53 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.3 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  32.1 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.14 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  42.16 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  31.67 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  29.87 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  41.33 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  29.87 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  32.47 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  27.08 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.31 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  28.11 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  31.52 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  28.7 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  31.94 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  29.52 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  27.32 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  31.16 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  27.46 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  26.49 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  28.96 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.49 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  28.44 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  26 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  29.94 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  45.71 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  28.95 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  29.45 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  54 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  45.59 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  51.67 
 
 		 135 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  45.59 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  32.42 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  29.03 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  26.18 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  30.23 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  28.3 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  28.3 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  25.7 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  31.39 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  28.77 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  23.44 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  30.35 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  24.75 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  28.77 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  24.23 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  29.63 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  54.9 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  39.06 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  42.65 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  30.9 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  30.9 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>