226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1623 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  43.07 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  41.55 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  41.1 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  38.01 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  37.7 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  38.22 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  35.12 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  39.6 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  30.33 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.4 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.96 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  34.97 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  31.11 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.59 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.43 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  30.84 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  32.88 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  28.7 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  32.43 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  29.05 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  30.53 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  45.92 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.66 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.4 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  28.08 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  28.08 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  36.36 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  30.93 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  28.51 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  27.91 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.69 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  44.29 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  30.37 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  50.75 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  34.01 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  50.75 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  25.85 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  50.75 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.33 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  36.59 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  31.07 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  26.36 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  44.78 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  26.57 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  27.53 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  46.25 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  26.79 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  27.67 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  26.57 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  26.57 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  28.37 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  26.57 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  28.04 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  44.93 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  31.79 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  27.64 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  27.88 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  27.08 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  27.47 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  29.67 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  27.54 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  29.63 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  29.89 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  27.54 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  27.54 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  27.54 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  26.16 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  27.12 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  29.51 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  29.21 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  27.98 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  27.59 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  29.9 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  46.38 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  28 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  27.41 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  25.25 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  28.08 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  26.7 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  41.79 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>