239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1599 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 270 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  83.76 
 
 		 282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  79.26 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  73.63 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  77.12 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  77.08 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  69.26 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  68.52 
 
 		 263 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  68.89 
 
 		 256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  68.75 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  68.75 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  69.12 
 
 		 256 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  67.9 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  68.75 
 
 		 256 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  70.11 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  68.63 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  47.14 
 
 		 235 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  46.7 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  46.93 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  42.79 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  42.23 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  41.71 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  42.5 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  36.73 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  36.73 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  38.38 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  39.7 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  34.17 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  37.11 
 
 		 235 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.45 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  34.47 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  34.47 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.2 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.05 
 
 		 238 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.12 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  33.17 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30.99 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.87 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  31.02 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  30.52 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.54 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  30.84 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38.27 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  37.66 
 
 		 215 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  37.66 
 
 		 215 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.42 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.28 
 
 		 224 aa  92  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  33.53 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  34.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  34.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  34.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  31.5 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.18 
 
 		 222 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  32.66 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  33.33 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  29.74 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  34.57 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  30.15 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  30.15 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  30.15 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  30.15 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  30.15 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  29.21 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  31.37 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  26.92 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  31.37 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  31.37 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>