233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2945 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  96.48 
 
 
256 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  96.48 
 
 
256 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  96.48 
 
 
256 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  83.59 
 
 
253 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  82.42 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  82.03 
 
 
256 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  77.52 
 
 
259 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  76.19 
 
 
253 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  73.46 
 
 
260 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  68.15 
 
 
270 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  67.78 
 
 
282 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  69.85 
 
 
263 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  71.09 
 
 
242 aa  360  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  68.75 
 
 
270 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  77.13 
 
 
261 aa  353  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  54.68 
 
 
235 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  55.5 
 
 
236 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  47.58 
 
 
235 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 
236 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  43.75 
 
 
228 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  41.46 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  41.4 
 
 
256 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 
226 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  38.97 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.33 
 
 
233 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.33 
 
 
233 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  36.14 
 
 
225 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  36.14 
 
 
225 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.41 
 
 
229 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  37.89 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  39.09 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
242 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  39.09 
 
 
237 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  37.25 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  37.25 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  34.54 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.17 
 
 
222 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  35.41 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  34.48 
 
 
221 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 
229 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 
225 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.64 
 
 
238 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.12 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  36.9 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  30.43 
 
 
222 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  34.25 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.81 
 
 
229 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  37.28 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  32.09 
 
 
293 aa  95.5  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  36.05 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  33.67 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  37.41 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  32.6 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  31.79 
 
 
221 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  34.65 
 
 
248 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  34.18 
 
 
248 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.09 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  29.58 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  30.82 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  29.74 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  30.65 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  32.78 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  27.22 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  30.11 
 
 
228 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  30.65 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  27.22 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  32.37 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  27.36 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  31.61 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30.38 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  31.61 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  30.97 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  30.97 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>