246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0518 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  100 
 
 
293 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  46.46 
 
 
222 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  36.97 
 
 
225 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  36.97 
 
 
225 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  40.69 
 
 
223 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  37.06 
 
 
234 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  38.69 
 
 
221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  38.69 
 
 
221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 
227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.73 
 
 
221 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  36.49 
 
 
227 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  35.03 
 
 
225 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  31.47 
 
 
233 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  34.48 
 
 
228 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.49 
 
 
233 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  37.06 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  35.23 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  35.23 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  35.23 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  33.67 
 
 
251 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 
228 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  37.2 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 
277 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  33.65 
 
 
245 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 
277 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 
277 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 
277 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  35.41 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.51 
 
 
236 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  34.36 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.03 
 
 
224 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 
236 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  33.5 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.63 
 
 
229 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
228 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  32.46 
 
 
224 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.88 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
228 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.46 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  31.69 
 
 
248 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 
222 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  30.85 
 
 
248 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  32.86 
 
 
263 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  31.68 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  31.68 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 
225 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  33.8 
 
 
261 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  33.03 
 
 
282 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  33.7 
 
 
228 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  32.38 
 
 
260 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  32.32 
 
 
231 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 
240 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 
231 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 
231 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 
231 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  32.32 
 
 
231 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  31.02 
 
 
270 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  31.84 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 
231 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  32.02 
 
 
259 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  31.16 
 
 
236 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 
235 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  31.12 
 
 
256 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  31.48 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  31.02 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30 
 
 
221 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 
232 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 
232 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 
232 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  31.03 
 
 
242 aa  99  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 
232 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 
232 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  30.26 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  30.26 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 
253 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  32.71 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  32.71 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.28 
 
 
222 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  32.24 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  30.88 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  30.85 
 
 
223 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 
235 aa  94  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  31.31 
 
 
256 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>