252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1527 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  100 
 
 
225 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  49.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  49.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  49.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  49.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  49.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  55.05 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  52.24 
 
 
224 aa  209  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  46.93 
 
 
225 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  51.09 
 
 
228 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  50.44 
 
 
225 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  50.66 
 
 
228 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  49.57 
 
 
231 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  49.14 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  49.14 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  49.14 
 
 
231 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  49.14 
 
 
231 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  48.71 
 
 
231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  48.71 
 
 
231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  48.71 
 
 
231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  49.14 
 
 
231 aa  198  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  51.52 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  47.68 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  45.05 
 
 
235 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  48.22 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  46.82 
 
 
215 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  46.82 
 
 
215 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  41.4 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  40.3 
 
 
226 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  39.3 
 
 
221 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  39.3 
 
 
228 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  50.76 
 
 
221 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  41.95 
 
 
228 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  47.24 
 
 
237 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  45.9 
 
 
248 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  35.62 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  44.69 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  45.36 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  44.69 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  43.17 
 
 
251 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  37.21 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  42.33 
 
 
234 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  46.01 
 
 
248 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  42.65 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  44.25 
 
 
280 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  39.02 
 
 
224 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  44.25 
 
 
280 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  44.25 
 
 
280 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  44.58 
 
 
277 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  44.58 
 
 
277 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  44.58 
 
 
277 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  44.58 
 
 
277 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  43.1 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  38.12 
 
 
235 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  48.34 
 
 
240 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  47.02 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  40.2 
 
 
242 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  43.29 
 
 
220 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  40 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 
221 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  36.11 
 
 
236 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  42.51 
 
 
216 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 
223 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  41.92 
 
 
216 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  36.41 
 
 
233 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  37.11 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  33.84 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  37.78 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  36.02 
 
 
233 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  37.06 
 
 
229 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
224 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  33.5 
 
 
293 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  34.36 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
225 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  37.17 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  34.25 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  41.62 
 
 
217 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 
221 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 
221 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  34.35 
 
 
227 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
236 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.82 
 
 
225 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.82 
 
 
225 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  32.18 
 
 
263 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  34.81 
 
 
221 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 
237 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.15 
 
 
236 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  28.44 
 
 
226 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
222 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.28 
 
 
225 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  39.67 
 
 
223 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  39.67 
 
 
223 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 
218 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  33.11 
 
 
228 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>