262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1935 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  85.59 
 
 		 229 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  59.21 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  60.09 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  58.79 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  53.62 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  53.62 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  54.76 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  51.27 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  50.67 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  44.93 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  40.1 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  40.64 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  41.33 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  41.33 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  36.04 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  35.12 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  37.21 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  37.17 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  36.07 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  39.76 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  34.82 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  36.28 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  35.98 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  43.75 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  36.94 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  37.17 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.48 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  34.56 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  36.41 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  38.17 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  38.17 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  35.35 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  34.39 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  36.92 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  34.08 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  35.1 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  34.67 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  35.41 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  36.81 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  36.68 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  36.81 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  35.94 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  37.06 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.52 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  33.95 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  36.94 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  33.84 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  33.02 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  36.1 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  36.6 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  34.27 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  34.18 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  34.36 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  37.27 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  34.9 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  33.52 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  35.23 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  35.44 
 
 		 263 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  36.22 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  34.29 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  35.57 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  30.96 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  32.49 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  32.52 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  37.37 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  33.51 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  32.49 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  32.18 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  30.5 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  35.82 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  28.97 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  33.76 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  32.99 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  28.8 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.74 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  33.85 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  29.59 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  38.26 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  28.93 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.95 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  31.95 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>