260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0928 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  48.65 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  41.63 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  44.78 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  37.96 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  41.55 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  39.34 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  39.34 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  39.91 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  39.91 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  40.69 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  37.8 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  40.2 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40.2 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  38.78 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.89 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  36.94 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  37.69 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  37.37 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  44.38 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  44.38 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  36.24 
 
 		 270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  38.97 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.86 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  39.38 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.6 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  35.57 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  32.31 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  48.12 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  36.18 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  35.35 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  35.78 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  38.04 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.86 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  34.55 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  35.48 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  34.31 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  32.57 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  34.36 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  36.98 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  33.03 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  33.04 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.83 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.83 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  32.68 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.83 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  35.35 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.82 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  34.67 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  34.54 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  34.33 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  33.83 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  33.83 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  33.83 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  33.83 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  33.83 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  37.79 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.47 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  32.28 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  36.18 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  32.49 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  30.92 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  33.89 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  34.31 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  31.95 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  31.95 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  33.76 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  31.15 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  31.31 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  30.5 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.42 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  30.05 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  36.65 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  31.44 
 
 		 280 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  31.44 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>