263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3479 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  85.59 
 
 		 229 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  57.14 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  56.7 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  60.48 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  55.33 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  55.33 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  49.36 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  50.85 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  52.79 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  44.93 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  40.64 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  40.61 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  40.61 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  34.67 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  34.56 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  39.8 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.5 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.48 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  35.79 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  32.87 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  43.06 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  37.13 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  38.92 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  37.3 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  34.78 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  35.45 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  34.46 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  34.46 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  36.76 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  37.57 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  34.56 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  34.58 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  35.68 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  35.08 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  34.26 
 
 		 270 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.41 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  36.84 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  35.03 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  37.24 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  33.91 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.13 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.67 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.92 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  33.53 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  34.36 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  31.63 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  31.7 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  35.88 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  34.72 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  37.95 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  36.6 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  32.3 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  34.15 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  37.37 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  33.48 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.18 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  34.47 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  33.97 
 
 		 256 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  34.69 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  31.47 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  32.99 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.66 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  31.47 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  30.04 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  39.74 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30.29 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.09 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  34.73 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  33.83 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  32.26 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  35.34 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.36 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  31.36 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  36.88 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  31.18 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  34.21 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  32.51 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  32.51 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  32.51 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  31.61 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.51 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>