248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2848 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  71.77 
 
 		 237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  71.77 
 
 		 227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  51.29 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  55.28 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  54.59 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  56.57 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  54.82 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  45.98 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  52.79 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  52.79 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  44.34 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  45.41 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  42.65 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  42.98 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  41.5 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  41.79 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  41.79 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  41.55 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  39.2 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  42.29 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  37.84 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  40.39 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  34.12 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  38.07 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  36.2 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  38.02 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  38.02 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  32.29 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  34.36 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  35.61 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  36.98 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  35.15 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  38.86 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  37.5 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  36.68 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  37.25 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  36.76 
 
 		 256 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  36.79 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  37.13 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  36.82 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  36.82 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 270 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  35.86 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  35.86 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  35.4 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  36.32 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  36.32 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  36.32 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  38.12 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  36.32 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  36.32 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  33.17 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  35.86 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  36.2 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  38.12 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  35.82 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.34 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  32.02 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  37.62 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  36.2 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  36.2 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.67 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  36.32 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  35.78 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.6 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.78 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 		 282 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  35.35 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  35.15 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  33.85 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  36.24 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.12 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  32.29 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  38.55 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  35.95 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  38.62 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  36.55 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>