251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0344 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  100 
 
 		 221 aa  413  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  76.02 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  76.02 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  53.85 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  53.85 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  50.52 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  50.51 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  49.74 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  42.92 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  49.23 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  38.29 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  43.94 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  41.21 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  43.94 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  43.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  43.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  43.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  43.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  43.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  44.55 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  43.43 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  42.79 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  44.55 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 		 280 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  45.28 
 
 		 248 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  45.28 
 
 		 248 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 		 280 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  42.79 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  42.79 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  42.79 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  45.71 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  45.89 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  42.78 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  42.79 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  46.38 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  45.92 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  49.12 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  40.67 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  42.56 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  44.06 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  39.9 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  44.09 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  41.71 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  39.91 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  43.59 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  38.73 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  41.88 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  38.34 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  39.02 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  51.47 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  36.44 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  41.45 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  36.89 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  35.78 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  34.98 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  34.97 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40.41 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  37.62 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  35.14 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  35.36 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  36.98 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  33.84 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  36.46 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  37.11 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  30.61 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  33.51 
 
 		 256 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  34.01 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  35.57 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  34.2 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  35.94 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  42.11 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  39.29 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  31.38 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.64 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  34.67 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  37.25 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  32.31 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  32.82 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>