238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1717 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  99.55 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  80.63 
 
 		 225 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  44.38 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  36.11 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  37.91 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  41.51 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  41.51 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  38.81 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  40.99 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  36.24 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  34.56 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  38.73 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  41.01 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  38.04 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  33.92 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  40.31 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  43.8 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  44.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  43.8 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  39.66 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  38.38 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  43.75 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  40.45 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  40.45 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  39.85 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.79 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38.41 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  43.41 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  38.52 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  37.78 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  43.8 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  40.11 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  35.8 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.43 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  42.19 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  39.55 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  39.55 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  39.55 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.81 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.51 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  38.62 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  38.62 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.51 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.51 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  38.76 
 
 		 247 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.51 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  39.89 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.18 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.87 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  42.45 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  42.96 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  44.53 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.44 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  34.16 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  37.4 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  34.97 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  41.43 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  32.63 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  32.43 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  39.58 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  41.27 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  33.58 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  42.97 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  40.6 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  27.37 
 
 		 270 aa  88.6  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  34.78 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 261 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  42.76 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  30.96 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  39.23 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  39.23 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  35.11 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  42.07 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.48 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>